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23/01/2025
A Heredity, revista oficial da Sociedade de Genética do Reino Unido e um dos periódicos que integram o portfólio da Nature, publicou, na última semana, um artigo assinado pelo professor Kaio Olimpio (centro da foto), do Departamento de Biologia Geral da UFV, e pelos egressos do programa de pós-graduação em Genética e Melhoramento da Universidade, Filipe Ferreira (à esq. na foto) e Saulo Chaves (à dir. na foto). O texto apresenta à comunidade científica o gencomp, um aplicativo computacional que os pesquisadores desenvolveram para auxiliar na seleção face à presença de competição no melhoramento de plantas anuais e florestais. O aplicativo integra as atividades do Instituto de Inteligência Artificial e Computacional da UFV (Idata), iniciadas, em 2024, no campus Viçosa.
O gencomp é um novo pacote no software R, projetado para simplificar o uso de modelos de competição genética em rotinas de melhoramento vegetal. No artigo da Heredity, os pesquisadores explicam que a capacidade de competição de uma planta é influenciada pela sua genética, e que tal competição pode mascarar o verdadeiro mérito dos indivíduos em avaliação, levando a seleções subótimas e divergência entre os ganhos genéticos esperados e reais. Com o gencomp, pesquisadores poderão, segundo o professor Kaio, obter facilmente estimativas não só do potencial dos candidatos à seleção, mas também de sua capacidade competitiva. Poderão, ainda, verificar a existência de tendências no campo e, especificamente para espécies florestais, averiguar o desempenho esperado de plantios compostos de diferentes materiais, levando em consideração a capacidade competitiva de cada um deles.
O pacote é mais um produto da linha de pesquisa em competição genética seguida pelo Laboratório de Genética Quantitativa e Aprendizado Estatístico, liderado pelo professor Kaio. Outros dois artigos que abordam o mesmo tópico já haviam sido publicados pelo grupo na renomada revista Forest Ecology and Management: A novel strategy to predict clonal composites by jointly modeling spatial variation and genetic competition (Ferreira et al. 2023) e Competition effects can mislead selection in eucalypt breeding trials (Ferreira et al. 2024). O artigo sobre o aplicativo, intitulado Incorporating spatial and genetic competition into breeding pipelines with the R package gencomp (Chaves et al. 2025) pode ser conferido no link: www.nature.com/articles.
O gencomp está disponível gratuitamente através do GitHub do professor Kaio, onde é possível encontrar instruções sobre como instalá-lo e utilizá-lo.
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